Podľa názoru vedcov má melatonín silné antioxidačné účinky a významným spôsobom chráni pred chorobami srdca, rakovinou a očným zákalom. Dokáže totiž neutralizovať účinky stresu a podporovať imunitný systém. Niektorí nadšenci dokonca označujú melatonín za hormón mladosti, keďže spomaľuje prirodzenú degeneráciu orgánov spôsobovanú voľnými radikálmi.
Nad umelým dopĺňaním melatonínu, ktoré by malo kompenzovať jeho telesnú produkciu, však visí otáznik. Preto je dôležité podporovať jeho prirodzenú tvorbu. Najmä, ak sa zistilo, že samovoľnú produkciu melatonínu výrazne potláča na prvý pohľad celkom nevinné umelé osvetlenie a existuje priamy vzťah medzi výskytom rakoviny prsníka a pravidelnými nočnými smenami či trvalým ponocovaním (hlavne od polnoci do rána) - narušená tvorba melatonínu totiž podnecuje zvýšené uvoľňovanie estrogénu vo vaječníkoch, v dôsledku čoho sa riziko výskytu rakoviny prsníka zvyšuje až o 60 percent.